隠し要素/第3次
第3次スーパーロボット大戦の隠し要素
- ルート分岐が複雑なのが当作品の特徴。特定キャラの存在が分岐に関係することも。詳しくは全話一覧/第3次にて。
エマ＆ガンダムMk-II
シナリオ#2もしくは#3「G-3」でアムロでエマを説得し、離脱させる。「DCを追う」場合「暗礁空域」クリア後、シナリオ#6「フォン・ブラウン」に進めばクリア後加入。「謎の敵を追う」場合シナリオ#9「大気圏突入」でアムロかカミーユでエマを説得すれば加入。「暗礁空域」から「大気圏突入」に直行した場合は仲間にできない。
クワトロ＆ロベルト＆アポリー
シナリオ#1「暗雲」、もしくはシナリオ#5「暗礁空域」でアムロでシャアを説得するとシナリオ#20「宇宙へ」で加入。同時に百式とリック・ディアス2機を入手。この場合彼らの加入と引き換えにセイラが離脱する。
セイラ残留＆ケーラ
シャアを説得しなかった場合、セイラは最後まで残留。またシナリオ#20「宇宙へ」でケーラが加入。同時に百式、リック・ディアス1機、リ・ガズィを入手。
カツ＆Gディフェンサー
上記を参考にエマ加入・セイラ残留の条件を満たすとシナリオ#21「静寂の中で」で登場し加入する。
キース＆ガンキャノン（2機目）
シナリオ「G-3」クリア後「謎の敵を追う」を選べば無条件に、「DCを追う」を選んだ後「大気圏突入」を選択し9ターン以内でクリアすればどちらの場合でも#11「ガンダム強奪」で加入。モンシアはスポット参戦のみ。
ズゴックE
シナリオ#5「暗礁空域」クリア後「フォン・ブラウン」を選べば無条件に、「大気圏突入」を選択した場合10ターン以上かけてクリアすればどちらの場合でも#12「熱砂の大地」で入手。こちらではキースが1MAPのみのスポット参戦。
ディジェSE-R
シナリオ#14「シーサイドパニック」でクリアまでに６ターン以上かければフォウから入手。
バーニィ＆ザク
シナリオ「宇宙へ」でクリスとバーニィを戦闘させておき、シナリオ「静寂の中で」でクリスでバーニィを説得すれば加入。
クェス
クワトロが仲間におらず、DC追撃をしない場合のシナリオ#29「シャングリラ」で「横40：縦8」の座標にアムロを移動させるとクリア後加入。
フォウ
シナリオ#34「恐怖！機動ビグ・ザム」を通る場合、カミーユでフォウを説得後サイコガンダムを破壊すれば仲間になる。通らなかった場合シナリオ#50「ラビアンローズ」開始までのターン300以下ならカミーユでフォウを説得し、サイコガンダムMk-IIを破壊すれば仲間になる。
リューネ＆ヴァルシオーネ
シナリオ#35「リューネ、そしてヴァルシオーネ」でNPCのリューネをDC全滅まで生かしておく。その後撃墜すればクリア後加入。射程は短いが攻撃力は高く挑発を使える唯一のキャラなので重要。
胡蝶鬼＆メカ胡蝶鬼
シナリオ#36「ジャブローの嵐」でリョウで胡蝶鬼を2回説得すれば加入。CB版では激励を使える貴重なキャラだが、倒すとミノフスキークラフトを落とすため選択に悩む。
ライディーン追加武装
シナリオ#40「バミューダ・トライアングル」をクリアするとゴッドボイスが追加される。このステージはターン数経過が特殊で１ターンで2ターン分時間が過ぎてしまうため、シナリオ#62「ラグナロク」（隠し最終話）を目指す場合は注意。また、ゴッドボイスを７回以上使うとシナリオ「ラスト・バトル」（３ステージ共通）でライディーンは出撃不能になる。「ラグナロク」では出撃可能に戻る。
セシリー＆ビギナ・ギナ
シナリオ#44「マチルダ救出作戦」もしくは#45「妹よ！」でシーブックでセシリーを説得すれば加入。
プル＆キュベレイMk-II
シナリオ#45「妹よ！」でジュドーでプルを説得するか、この2人が戦闘して生き残っていればその場で加入。
マリア
同じく「妹よ！」でデュークでマリアを説得するか、この2人が戦闘して生き残っていればその場で加入。
サザビー
シナリオ#46「悲しみの果てに」でデュークでナイーダを2回説得するとスポット参戦の味方になる。クリアまで生かしておけばサザビーを入手可能。
プルツー＆ヤクト・ドーガ (クェス専用)
シナリオ#48「プルとプルツーと」でプルとプルツーを戦闘させ、プルとジュドーでプルツーを説得すれば味方になる。このMAPではサイコMk-IIを使用できるがクリア後廃棄。代わりに何故かヤクト・ドーガが手に入る。
隠し最終話
シナリオ「ラスト・バトル」（３ステージ共通）にシュウ・シラカワを出撃させ生存しており、終了までの総ターン数がSFC版：419、PS版：350以内 で隠し最終話の「ラグナロク」に進めるようになる。