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復活したスクラッグを完全に撃破した後、石神の隠していた真実、即ち[[ヒトマキナ]]の存在を知った彼らは、その意志に従い[[月]]内部のヒトマキナの拠点攻略作戦を実行。フェストゥムやELS、バジュラとの対話の道を切り開き、怨敵[[ハザード・パシャ|ハザード]]とザ・ブーム軍を、さらに彼らを撃破した直後の[[バジュラ本星]]での戦闘にて人類軍と[[マクロス・フロンティア船団|フロンティア船団]]首脳部を抹殺し全銀河の支配を企てた[[マクロス・ギャラクシー船団|ギャラクシー船団]]の首脳部も和解した[[バジュラ]]・[[フェストゥム]]・[[ELS]]の助力も得て撃破。そして、ヨグ＝ソトースの門の先にある未来の宇宙にて[[マスターテリオン]]を撃破、同時に全ての黒幕であった[[ナイア|邪神ナイアルラトホテップ]]の計画を完全に崩壊させたことで、地球圏の脅威を完全に取り除くも、部隊の帰還は事実上不可能となった。

復活したスクラッグを完全に撃破した後、石神の隠していた真実、即ち[[ヒトマキナ]]の存在を知った彼らは、その意志に従い[[月]]内部のヒトマキナの拠点攻略作戦を実行。フェストゥムやELS、バジュラとの対話の道を切り開き、怨敵[[ハザード・パシャ|ハザード]]とザ・ブーム軍を、さらに彼らを撃破した直後の[[バジュラ本星]]での戦闘にて人類軍と[[マクロス・フロンティア船団|フロンティア船団]]首脳部を抹殺し全銀河の支配を企てた[[マクロス・ギャラクシー船団|ギャラクシー船団]]の首脳部も和解した[[バジュラ]]・[[フェストゥム]]・[[ELS]]の助力も得て撃破。そして、ヨグ＝ソトースの門の先にある未来の宇宙にて[[マスターテリオン]]を撃破、同時に全ての黒幕であった[[ナイア|邪神ナイアルラトホテップ]]の計画を完全に崩壊させたことで、地球圏の脅威を完全に取り除くも、部隊の帰還は事実上不可能となった。

しかし、その矢先に[[ノーヴル・ディラン]]の招集を受けたUXは、ユガの狭間で彼女と対峙。そこで世界の真実を知った彼らは、世界をリセットすべく現れた[[カリ・ユガ]]を撃破。[[春日井甲洋]]や[[フェイ・イェンHD]]らの導きを受け、門を潜る前の元の世界へと戻って行った。

しかし、その矢先に[[ノーヴル・ディラン]]の招集を受けたUXは、ユガの狭間で彼女と対峙。そこで世界の真実を知った彼らは、世界をリセットすべく現れた[[カリ・ユガ]]を撃破。[[春日井甲洋]]や[[フェイ・イェンHD]]、そしてカリ・ユガとの戦いで力を貸してくれた魂たちの導きを受け、門を潜る前の元の世界へと戻って行った。

その後しばらくは混乱の収拾のため活動していたが、事態終結後、「[[世界観/UX|並列世界]]」の面々はそれぞれの地球へ帰還。「この世界」のメンバーも元の居場所へと戻り、部隊は解散。旧UXのメンバーは[[傭兵]]には戻らず、アーニーが主導した施設の職員として身を置くこととなった。

その後、しばらくは混乱の収拾のため活動していたが、事態終結後、「[[世界観/UX|並列世界]]」の面々はそれぞれの地球へ帰還。「この世界」のメンバーも元の居場所へと戻り、部隊は解散。旧UXのメンバーは[[傭兵]]には戻らず、アーニーが主導した施設の職員として身を置くこととなった。

以上の記述は、あくまで'''ゲームにおいて再現されている「あるループ」における部隊の動向'''であり、UXの世界観における他のループでどうであったかは不明（少なくとも、存在していないループも多く確認されている）。

以上の記述は、あくまで'''ゲームにおいて再現されている「あるループ」における部隊の動向'''であり、UXの世界観における他のループでどうであったかは不明（少なくとも、存在していないループも多く確認されている）。