『[[第2次スーパーロボット大戦Z破界篇]]』の全話一覧。
*全50話
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| 第1話 || 100万Gの男
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| 第2話 || 変わる世界
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! 選択分岐 !! 日本へ向かう<br />（日本ルート）<br />（マジンガー、ダイ・ガード） !! ソレスタルビーイングを追う<br />（ソレスタルビーイング追跡ルート）<br />（ガンダム00）
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| 第3話 || 始動！マジンガー！ || 戦火を呼ぶ流星
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| 第4話 || やってきた災厄 || 混沌の戦場
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! 選択分岐 !! 日本ルート<br /> マジンガー、ダイ・ガード、<br />（トライダー、ゴッドマーズ）!! ソレスタルビーイングに投降する<br />（ソレスタルビーイング追跡ルート）<br />ガンダム00、<br />（ゲッター、ノヴァ） !! コロニーのガンダムを追う<br />（エリア11ルート）<br />同行者なし<br />（ボトムズ、ガンダムW、ギアス）
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| 第5話 || こちら宇宙の何でも屋 || 超獣合神！ || バトリング
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| 第6話 || 目覚める力 || 遠い平和へ || 魔神が生まれた日
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| 第7話 || 驚異の六神合体 || 出撃！！ゲッターロボ！ || その名はゼロ
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| 第8話 || 試される覚悟 || 引き鉄は誰がために || 皇女と魔女
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! 選択分岐 !! colspan="2" | 暗黒大陸ルート <br />マジンガー、ゲッター、トライダー、ゴッドマーズ、<br />ガンダム00、ノヴァ、ダイ・ガード、（グレンラガン）!! colspan="2" | フロンティア船団ルート<br />ゲッター、ガンダムW、ガンダム00、<br />ノヴァ、（マクロスF）
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| 第9話 || 次元震 || 次元震 || 次元震 || 次元震
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| 第10話 || colspan="2" | お前のドリルで天を突け！！ || colspan="2" | クロース・エンカウンター
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| 第11話 || colspan="2" | 顔が2つたあ生意気なッ！！ || colspan="2" | オン・ユア・マークス
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| 第12話 || colspan="2" | 俺にはさっぱりわからねえ！ || colspan="2" | ファースト・アタック
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| 第13話 || 黒の騎士団
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| 第14話 || 信頼と覚悟と
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| 第15話 || 世界を覆う影
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! 選択分岐 !! 表部隊と行く<br />（表部隊ルート）<br />マジンガー、トライダー、ゴッドマーズ、<br />ダイ・ガード、マクロスF、グレンラガン !! 裏部隊と行く<br />（裏部隊ルート）<br />ゲッター、ボトムズ、ガンダム、<br />ノヴァ、ギアス、（エウレカ）
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| 第16話 || BIRD-HUMAN || 接触
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| 第17話 || 夜の新宿大決戦 || 夢の続き
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| 第18話 || オープニング・ステージ || 交差する明日
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| 第19話 || みんなの正義
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| 第20話 || 砂塵に舞う悪意
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| 第21話 || 明かされる真実
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| 第22話 || リモネシア強襲
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| 第23話 || 新世界の幕開け
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! 選択分岐 !! 国連に引き続き協力する<br />（国連協力ルート）<br />マジンガー、ゲッター、トライダー、ゴッドマーズ、<br />ダイ・ガード、グレンラガン、エウレカ、<br />（ザンボット、オーガス、ザブングル、ガンダムX、∀、キングゲイナー） !! 宇宙に上がる<br />（宇宙ルート）<br />ガンダム00、ノヴァ、マクロスF、<br />（Ζガンダム、SEED、グラヴィオン、アクエリオン） !! エリア11へ向かう<br />（エリア11ルート）<br />ボトムズ、ガンダムW、ギアス
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| 第24話 || 異邦人の来訪 || 相容れぬ遂行者 || ナリタ攻防戦
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| 第25話 || 遠い世界 || 新たな来訪者 || 絆
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| 第26話 || 集う力 || 断ち切られる帰路 || ギアス対ギアス
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| 第27話 || 呪われし放浪者 || 黒衣の狩人 || 神の島
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| 第28話 || 放浪のZEUTH
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| 第29話 || 反撃の狼煙
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| 第30話 || ストレート・フルクラム
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| 第31話 || 対決！マーズとマーグ！
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| 第32話 || あばよ、ダチ公…
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| 第33話 || 天を突く命
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! 選択分岐 !! 日本へ向かう<br />（日本ルート）<br />マジンガー、ゲッター、ザンボット、<br />トライダー、ゴッドシグマ、バルディオス、<br />ゴッドマーズ、ザブングル、ダイ・ガード、<br />キングゲイナー、グレンラガン、エウレカ!! ソレスタルビーイングに同行する<br />（ソレスタルビーイングルート）<br />オーガス、W以外のガンダム、ノヴァ、<br />グラヴィオン、アクエリオン、マクロスF !! エリア11へ向かう<br />（エリア11ルート）<br />ボトムズ、ガンダムW、<br />ビッグオー、ギアス、（ダイターン）
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| 第34話 || 思い出の中の父 || メモリアル・デビュー || 囚われの心
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| 第35話 || 進撃！機械獣大作戦！ || 悪意の矛先 || 炎
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| 第36話 || 命の果てにあるもの || 託される意志 || 血染めのユフィ
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| 第37話 || 雄々しく……そして、美しく
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| 第38話 || 果たされる約束
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| 第39話 || ザ・ラストレッドショルダー
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| 第40話 || 降臨！！ 真なる者！
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| 第41話 || マーグ、その命
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! 選択分岐 !! 暗黒大陸へと向かう<br />（暗黒大陸ルート）<br />マジンガー、ゲッター、無敵系、オーガス、ザブングル、ボトムズ、ガンダムW、<br />ビッグオー、ダイ・ガード、キングゲイナー、ギアス、グレンラガン、エウレカ !! 宇宙へと向かう<br />（宇宙ルート）<br />ゴッドシグマ、バルディオス、ゴッドマーズ、W以外のガンダム、<br />ダンクーガ系、グラヴィオン、アクエリオン、マクロスF
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| 第42話 || 明日への凱歌 || 想い重ねて、宇宙へ
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| 第43話 || 王都テッペリンへ || ロゼの決意
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| 第44話 || 怒りの螺旋王 || 未来への飛翔
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| 第45話 || リトル・クイーン
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| 第46話 || 邪悪の化身
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| 第47話 || 迎えられる勝者
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| 第48話 || 夜明けの鐘
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| 第49話 || 虹
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| 第50話（最終話） || 破界の世紀
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