隠しユニット＆パイロット関係
スコープドッグTC・ISS
*（1）:第39話「ザ・ラストレッドショルダー」前半ステージで、キリコ、バーコフ、コチャック、ゴダン、ザキがそれぞれ1機以上撃墜する。
*（2）:後半ステージで、イプシロンをキリコで撃墜する。
*（3）:以上の条件をすべて満たし、キリコの撃墜数が70以上の場合、クリア時に入手。
トルネードパック
*（1）:第33話終了後の分岐でCBルートへ進む。
*（2）:「メモリアル・デビュー」「雄々しく……そして、美しく」で同じ選択をする。
*（3）:第45話「リトル・クイーン」でアルト突入時、撃墜数が70以上だと復帰時に入手。
何気に本作で唯一'''ルート分岐が隠し要素に関わる'''。
パールネイル＆マルグリット
*（1）:「思い出の中の父」or「託される意思」or「血染めのユフィ」に出現するマルグリットをクロウで撃墜。
*（2）:「明日への凱歌」or「ロゼの決意」に出現するマルグリットをクロウで撃墜するか、説得する。
*（3）:第49話「虹」で、マルグリットかシュバルを撃墜するとその場で参戦。
ターミナス303 SP
*「天を突く命」クリア時にホランドの撃墜数が50以上だと、第49話「虹」での復帰時にスーパーパックがそのまま引き継がれる。
敵変更
*「砂塵に舞う悪意」でジョシュアを残したままクリアすると、第48話「夜明けの鐘」でGN-Xのパイロットとして出現する。